Em 1917, a área onde se encontra o Jardim Botânico de São Paulo, tornou-se propriedade do governo, passando a denominar-se "Parque do Estado". Até 1928 serviu para captação de águas, que abastecia o bairro do Ipiranga. Neste mesmo ano o naturalista Frederico Carlos Hoehne foi convidado para implantar um Horto Botânico na região. Em 1969 o parque passou a se chamar Parque Estadual das Fontes do Ipiranga, terceira maior reserva da Mata Atlântica do município de São Paulo. O jardim possui várias recantos e atrações, além de um importante ponto histórico, umas das nascentes do Riacho do Ipiranga.
Os Jardins Botânicos desempenham um papel muito importante na conservação da biodiversidade. O Jardim Botânico de São Paulo é importante na tarefa vital de conservação in-situ e ex-situ, muitas das quais na lista das espécies ameaçadas de extinção.
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